Slo-Tech - DeepMind je predstavil novi model AlphaGenome 2, ki je namenjen analizi in predvidevanju, kako spremembe v zapisu DNK v celicah vplivajo na delovanje celic, s tem pa tudi na izražanje genov in vpliv na pojav določenih bolezni. Lani so izdali prvi AlphaGenome, ki je napovedal aktivnost v celicah v različnih tkivih, nova verzija pa je bistveno izboljšana. Podrobnosti najdemo v tehničnem članku.
AlphaGenome 2 so natrenirali na več kot 100 milijonih individualnih celičnih profilih iz 68 različnih tkiv. S tem so velike atlase in kataloge posameznih celic spremenili v dinamični napovedni model, ki lahko napove posledice sprememb v DNK in izražanja različnih genov. AlphaGenome Atlas, ki ga je prvi AlphaGenom ustvaril pred dvema mesecema, na primer vsebuje napovedi, kaj povzročijo vse enočrkovne mutacije v človeškem genomu, ki jih je približno devet milijard. A tista verzija je imela omejene napovedni možnosti glede vpliva v posameznih vrstah celic.
Novi model AlphaGenome 2 lahko napoveduje tudi tiste vrste celic in biološka stanja, ki jih med treningom ni nikoli srečal. Prav tako lahko poišče vrzeli v eksperimentalnih podatkih in predlaga, katere poizkuse bi bilo smiselno opraviti. Vodja projekta genomika v DeepMindu je Žiga Avsec, ki je tudi vodilni avtor v članku. Za The Verge je povedal, da je AlphaGenome 2 bistveno dražji od predhodnika, zato ga ne bo takoj nadomestil. Atlasa za vse možne enočrkovne mutacije, kot so ga izdelali s prvo verzijo, z AlphaGenome 2 ne bi bilo smiselno pripravljati. Po drugi strani pa je bistveno boljši pri ciljanih napovedih za relevantne mutacije.
Model je za raziskovalno rabo že na voljo.
Novice » Znanost in tehnologija » Googlov DeepMind predstavil AlphaGenome 2 za napovedovanje vpliva sprememb DNK na celice
Vredno ogleda ...
| Tema | Ogledi | Zadnje sporočilo | |
|---|---|---|---|
| Tema | Ogledi | Zadnje sporočilo | |
| » | Kaj vemo o britanskem sevu SARS-CoV-2Oddelek: Novice / Znanost in tehnologija | 9055 (6246) | Mr.B |
| » | Sledi za novim koronavirusom vodijo do netopirjev in luskavcev (strani: 1 2 )Oddelek: Novice / Znanost in tehnologija | 20256 (17349) | carota |
| » | Kurzweil in kako narediti možgane (strani: 1 2 3 4 )Oddelek: Znanost in tehnologija | 29439 (27373) | Thomas |
| » | Prvi človek (strani: 1 2 )Oddelek: Problemi človeštva | 10849 (9175) | Rokm |
| » | Nastanek življenja (strani: 1 2 3 4 5 6 7 8 )Oddelek: Loža | 70325 (65550) | Vajenc |