» »

Znanstveniki zaradi Excela preimenovali 27 genov

Znanstveniki zaradi Excela preimenovali 27 genov

Slo-Tech - Biokemiki in biologi dajejo genom v organizmih sorazmerno dolgočasna imena, ker morajo slediti sistemu, ki zagotavlja poimenovanja več deset tisoč genov. Včasih je bilo drugače, zato smo imeli gene Sonic in Indy (I'm not dead yet), a danes je romantike konec. Včasih pa jo zagode Excel.

Spomnimo, da je gen zaključeno zaporedje baznih parov v dednem zapisu (DNK), ki se s prepisom v mRNK kasneje prevede v proteine (zaporedje aminokislin). Gene gradijo tričrkovna zaporedja ali kodoni (ki ustrezajo baznim parom), ki se prevajajo v aminokisline. Gen je tako načrt, katere aminokisline in v kakšnem zaporedju naj ribosom sintetizira. Vsak gen ima kratko ime in alfanumerično kodo. Imena genov so dolgočasna zaporedja: TP53, TNF, EGFR, VEGFA, APOE itd.

Včasih pa kašen gen preimenujejo, ker je to laže kot Microsoft prepričati, naj spremeni Excel. Čeprav je del pisarniškega paketa, se osupljivo veliko znanosti na neki točki znajde v Excelovih preglednicah. Ime gena MARCH1 (Membrane Associated Ring-CH-Type Finger 1) za Excel predstavlja težavo, ker ta zapis prepozna kot datum in ga avtomatično spremeni v 1. marec. To ni tako nedolžna napaka, kot se zdi, saj v dolgih tabelah lahko neopažena. Raziskave kažejo, da ima petina objavljenih člankov kakšno napako zaradi težav z Excelom. Excel sicer ni najbolj primerno orodje za delanje znanosti, je pa še vedno zelo enostavno in razširjeno, zato vsaj spočetka marsikdo podatke premetava kar tam.

Zato se je HUGO Gene Nomenclature Committee odločil, da preprosto preimenuje nekaj genov, da bi se izognili vsaj najpogostejšim težavam. HGNC je objavil prenovljena pravila za poimenovanje genov, ki so namenjena večji standardizaciji, med njimi pa je preimenovanje zaradi Excela manjši del. A vseeno, v znanstvenih navodilih uradno piše: Simboli, ki vplivajo na obdelavo in priklic podatkov, denimo simboli s samodejno pretvorbo v datum (MARCH1 in SEPT1 bosta postala MARCHF1 in SEPTIN1). Doslej so na tak način spremenili imena 27 genov. Ena proti nič za Excel proti znanosti.

24 komentarjev

wajdujc ::

Sedaj naj mi kdo razloži, da Excel ne poganja sveta naprej!

PrimoZ_ ::

Excel poganja 3/4 največjih podjetij.

;((

wajdujc ::

In 95% preostalih malih

antrim ::

Zakaj je vedno krivo orodje in ne tisti, ki ga ne zna uporabljati? "Znanstveniki" my ass.

zee ::

antrim je izjavil:

Zakaj je vedno krivo orodje in ne tisti, ki ga ne zna uporabljati? "Znanstveniki" my ass.


Forumski strokovnjak much? ;(

Se ne tako dolgo nazaj je bil Excel "the only game in town", ki je bil dovolj enostaven za uporabo, z rezultati, ki si jih lahko enostavno delil s sodelavci, prav tako raziskovalci, ki so zelo dobri pri nacrtovanju in izvajanju eksperimentov, malo manj pri ostalem, saj za to preprosto ni fizicno dovolj casa. Vcasih tudi ni prav nobene potrebe po Jupyter Notebook-u, NumPY-ju in se cem.
zee
Linux: Be Root, Windows: Re Boot
Giant Amazon and Google Compute Cloud in the Sky.

JanBrezov ::

wajdujc je izjavil:

Sedaj naj mi kdo razloži, da Excel ne poganja sveta naprej!

MS Office definitivno poganja svet naprej, a ga krati tudi drži nazaj. En primer je ta z geni, drugi problem je recimo vojska. V spodaj priloženem videu je intervju z navy seal-om, ki pravi, da če hočeš ustaviti US vojsko, je to najlažje naredit s hekanjem MS Office, ker vojska funkcionira na tem (video, od 10 min 30 s dalje).

Zgodovina sprememb…

bbf ::

Apa če bi en reku: "dost je tega avtomatskega oblikovanja celice, nej user sam določi tip!" Kolk mi gre na organ, ko vsakič nekej "popravlja" za mano. Čem zajebu, bom jest zajebu, ne me ti zdej jebat!

WhiteAngel ::

bbf je izjavil:

Apa če bi en reku: "dost je tega avtomatskega oblikovanja celice, nej user sam določi tip!" Kolk mi gre na organ, ko vsakič nekej "popravlja" za mano. Čem zajebu, bom jest zajebu, ne me ti zdej jebat!


To.

Isti debilizem dela tudi Word, ki ti magično iz direktnega oblikovanja zazna slog, s katerim si hotel pisati. ;((

antrim ::

zee je izjavil:

antrim je izjavil:

Zakaj je vedno krivo orodje in ne tisti, ki ga ne zna uporabljati? "Znanstveniki" my ass.


Forumski strokovnjak much? ;(



Aha. Ker rabiš vsaj dva doktorata, da znaš ročno določati kategorijo vnosa v celicah.

bbf ::

antrim je izjavil:

zee je izjavil:

antrim je izjavil:

Zakaj je vedno krivo orodje in ne tisti, ki ga ne zna uporabljati? "Znanstveniki" my ass.


Forumski strokovnjak much? ;(



Aha. Ker rabiš vsaj dva doktorata, da znaš ročno določati kategorijo vnosa v celicah.

Zakaj pa to ni po defaultu prepuščeno userju? Ker tisti doktorati so povzročil petino člankov z napakami. Hvala za tak skret od orodja. Ker ni pod direktno kontrolo userja se dogajajo take napake.

Okapi ::

V resnici bi lahko Excel sam ugotovil, kdaj je koristno kaj spreminjati, in kdaj ne. In potem bi še o spreminjanju, ali nespreminjanju, obvestil uporabnika.

bbf ::

Nič nima softwer za ugtavljat, al kej spreminjat, al ne, in težit okol. Če user ve, da garbič, ki ga je vnesel, rabi spremenit, ga bo že sam popedenal. Ne da pol excel neki napol tist garbič popedena, user se pa čudi, kaj so to za eni datumi vmes pol na zagovoru doktorata..

Okapi ::

Temu se reče AI, umetna pamet, in jo želimo imeti, da nam pomaga, med drugim popravljati naše napake.

GupeM ::

Okapi je izjavil:

Temu se reče AI, umetna pamet, in jo želimo imeti, da nam pomaga, med drugim popravljati naše napake.

Ja, temu se reče AI. In nekateri se celo bojijo, da nas bo izbrisala z obličja zemlje. Samo ime si bom dal spremenit v Maj, pa AI mislil da sem mesec, ne človek.

GR2 ::

Če imajo take probleme, zakaj preprosto ne izključijo samopopravkov? Ja vem, vedno se bo našel nekdo, ki bo imel nastavljeno na default.

antonija ::

Krasen primer zakaj je vendor lock-in zelo slaba stvar.
Excel poznajo vsi, excel imajo kupljen vsi. Sej se vmes najdejo heroji ki uporabljajo kak drug software, ampak ko je pa treba podatke deliti je pa na koncu vedno excel.

Userji bi seveda lahko poznali excel bolje, izkljucili samopoprvake, itd. Lahko se pa namesto tega raje ukvarjajo z znanostjo. Biokemik pac ne rabi biti tudi excel help desk.
Ne pozabit da znanost poskusa biti prakticna v razumnih mejah. Ce je lazje popravit pomenovanje 27 genov (izmed vec deset tisoc) kot pa da M$ popravi excel default config, potem se pac preimenuje gene.
Statistically 3 out of 4 involved usually enjoy gang-bang experience.

Zimonem ::

antonija je izjavil:

Krasen primer zakaj je vendor lock-in zelo slaba stvar.
Excel poznajo vsi, excel imajo kupljen vsi. Sej se vmes najdejo heroji ki uporabljajo kak drug software, ampak ko je pa treba podatke deliti je pa na koncu vedno excel.

Userji bi seveda lahko poznali excel bolje, izkljucili samopoprvake, itd. Lahko se pa namesto tega raje ukvarjajo z znanostjo. Biokemik pac ne rabi biti tudi excel help desk.
Ne pozabit da znanost poskusa biti prakticna v razumnih mejah. Ce je lazje popravit pomenovanje 27 genov (izmed vec deset tisoc) kot pa da M$ popravi excel default config, potem se pac preimenuje gene.

Za znanstvenika se predvideva da do neke mere obvlada orodje. Za neuke je pa sept1 konverzija priročna. Za ta spekter industrije je bil Excel tudi namenjen. Problem ni od včeraj. Ampak templatei in osnove formatiranje so bolj stvar srednje šole.

antonija ::

Zimonem je izjavil:

Za znanstvenika se predvideva da do neke mere obvlada orodje. Za neuke je pa sept1 konverzija priročna. Za ta spekter industrije je bil Excel tudi namenjen. Problem ni od včeraj. Ampak templatei in osnove formatiranje so bolj stvar srednje šole.
Sej obvladajo orodje... mnnogo njih. Predvsem tistih, s katerimi se pridobiva podatke. Orodja za katera se veicni populacije sploh ne sanja da obstajajo, kaj sele da bi vedeli kaj ta orodja pocnejo, ali celo kako delujejo.

Pri orodjih za izmenjavo/obdelavo podatkov se pa pojavi problem. Uporabljati morajo to, kar uporabljajo vsi, neglede na prilagojenost na njihovo stroko. Vendor lock-in in all its glory!

Se enkrat: Znanstveniki se prvenstveno ukvarjajo z znanostjo, povecini zelo specializirano stroko. Zato, da so sploh kompetentni za ukvarjanje z znanostjo, so se morali tekom solanja marsicemu odreci v zameno za znanje in izkusnje, ki jih potrebujejo za opravljanje svojega dela. To dostikrat vkljucuje tudi racunalniske vescine (razen za osebke ki so doticna znanja pridobili v prostem casu zaradi osebne motivacije).
Za template-e in formatiranje vecini dol visi, predvsem pa ni smiselno da se tisoce znanstvenikov vsakic sproti ukvarja s formatiranjem celic v excelu, ce lahko spremenijo nekaj okrajsav in problema ni vec.
Statistically 3 out of 4 involved usually enjoy gang-bang experience.

starfotr ::

Če bi označili zadeve, kot besedilo, bi bilo vse ok.

Ker pa si radi delajo delo, so šli raje preimenovat zadeve. Bravo znanost.

suse_80 ::

Meni pa je grozno amatersko,da velika podjetja uporabljajo Excel za resne namene, namesto da bi kupili namenski program za xy dejavnost.
Doživel nekajkrat v svoji karieri, da so v podjetjih npr. obračune porabljene toplotne energije v večstanovanjskih stavbah računali ročno z Excelom, medtem ko večina namenskega softvera to področje pokriva profesionalno ( in stane kar nekaj). Delali so tabele z več 10.000 vnosi, isto toliko formulami, in če se je kaj pokrompirilo, cele dneve iskali napako... vse zaradi prihranka in ker se kakšni starejši delavki ali uprvaniku ni dalo učiti namenskega programa in sta rajši blokirala prehod na nov sistem (doživeto in personam...).

antonija ::

Madonis, vecina tukajle razglablja v stilu komunisticnih filozofov... Sistem imate super, pozabljate pa da imate opravka z ljudmi. In ljudje so lahko leni, neumni, nepripravljeni na spremembe, utrujeni, navelicani, pod stresom, egoisticni, apaticni, itd.
Kaj ti pomaga da si nastavljas celico na text, ce bo naslednji copy/paste zadeve pokvaril? Kaj se bo zgodilo ko uredis excel z nekaj tisoc vrsticami, in ga dobi v roke tvoj mentor/sef, ki mu je excel znan kot "stvar za tabele" in se ni slisal da se lahko celice formatira?
Kako bos sforsiral prehod na nov software, ce pa hoce direktov vecji bonus ki ga dobi ce pokaze vec prihrankov? Valda ne bo kupivla novega SWja, sej "vse dela".
Zakaj bi se teta par let pred penzijo hotela ukvarjat z ucenjem novega SWja? Njen glavni cilj je coasting do penzije, to je vse.
Velikost podjetja nima tako velikega pomena tukaj, dokler so glavni faktor ljudje.

Ljudje so... ljudje. Upostevajte to dejstvo v miselnih experimentih.
Statistically 3 out of 4 involved usually enjoy gang-bang experience.

Matthai ::

The joy of closed source at its best.
All those moments will be lost in time, like tears in rain...
Time to die.

no comment ::

Znanstveniki bi z open source ponaredki imeli isti "problem".

(pa črtim M$ verjetno enako goreče kot vsak openfarter, ki da kaj nase)

Phantomeye ::

antrim je izjavil:

Zakaj je vedno krivo orodje in ne tisti, ki ga ne zna uporabljati? "Znanstveniki" my ass.


Ce orodje ni intuitívno, potem je problem v orodju ... in potem prihaja do napak.


Vredno ogleda ...

TemaSporočilaOglediZadnje sporočilo
TemaSporočilaOglediZadnje sporočilo
»

Nadaljevanje zgodbe o gensko spremenjenih dvojčicah in zakaj ju ne bi smeli dobiti

Oddelek: Novice / Znanost in tehnologija
306731 (2703) SaXsIm
»

Petina znanstvenih člankov iz genomike oporečnih zaradi Excela

Oddelek: Novice / Znanost in tehnologija
486562 (3225) filipk
»

Nastanek življenja (strani: 1 2 3 4 5 6 7 8 )

Oddelek: Loža
35733981 (29206) Vajenc
»

Kaj pomeni ustvariti umetno celico?

Oddelek: Novice / Znanost in tehnologija
3111656 (10169) Seto

Več podobnih tem