Nakup računalnika za bioinformatiko

Zdravo,

Zanimam se za nakup računalnika za srednje zahtevne bioinformacijske naloge.

Zahteve so torej precej pomnilnika (32 Gb), dovolj procesorske moči (razmišljal sem o i5 4690) in
najmanj 2 TB diska. grafika ni pomembna.

A mi lahko kdo svetuje primer stabilne in učinkovite konfiguracije za tovrstne namene?
Ima morda kdo izkušnje s tega področja, saj me zanima tudi,
če ni mogoče boljša opcija najem super-računalnika.

Hvala vnaprej za vse ideje, opombe, nasvete..

Lep pozdrav

A to za magisterij? Lahko se pozanimam, če je potrebno.

Katero programsko opremo uporabljaš za svoja opravila ?

Obdelava sekvenc je zaenkrat še precej raztrešena.
V glavnem obstajajo za vsak korak svoji odprtokodni programi ali algoritmi, ki se
jih nato povezuje (s Python-om, R-om, shell-om...)
Trenutno še zaganjamo, tako da se vse dogaja na naših osebnih PCjih.

Problem se pojavi zaradi količine podatkov. Od 10 - 15 Gb
.txt fajlov na sekvenciranje, ki jih je potrebno potem obdelat.

Na kakih delate zdaj? Procesor/ram/disk ?

Nevem kaj točno delate, ampak če imaš možnost za gpu pospeševanje, bi ga blo fajn izkoristiti: http://www.nvidia.com/object/bio_info_l...
ker bo hitreje od bilokaterega proca z kakim titanom naprimer.

Glede ECCja pa moraš sam približno vedeti ali se splača ali ne.

kupi enega titana zraven pa je.
problem je, da mora softver podpirat.

Super, hvala vsem za pomoč.

Lep pozdrav

AcoBetalow je 7. dec 2014 ob 12:06 izjavil:

A mogoče veste kateri super-računalnik pa se najbolj splača najemat?

Dvignem roko. Ker se ravno z desetinami terabajtov bioinformatike ukvarjam :)