Aleynikova so že leta 2010 obsodili zaradi kraje kode. Od osmih let zaporne kazni, ki mu je bila prisojena, je za zapahi preživel leto dni (marec 2011 - februar 2012), potem pa je prizivno sodišče razveljavilo sodbo zaradi napačne uporabe materialnega prava. Vseeno mu to kaj dosti ni pomagalo, saj mu je v tem času propadel zakon ter šla po gobe kariera. Avgusta 2012 so ga vnovič aretirali in mu začeli soditi na newyorškem sodišču; tokrat ga ni preganjala zvezna vlada temveč država New York.
Postopek se je končal v petek po nekaj bizarnih zapletih. Vmes je namreč kazalo, da se bo proces izjalovil in ga bo treba ponoviti (mistrial). Ena izmed članov porote je namreč drugega člana porote obtožila, da jo želi zastrupiti; šla je celo na preiskavo krvi. Domnevni zastrupljevalec pa je dejal, da mu je omenjena članica grozila z uničenjem kariere. Na koncu so oba člana porote odstranili, tožilstvo in obramba pa sta se strinjala, da se proces nadaljuje z 10 člani porote, s čimer so preprečili ponovitev procesa.
Odločitev porote v procesu ni bila soglasna. Soglasno so odločili, da je Aleynikov kriv kraje kode iz podjetja Goldman Sachs. Oprostili so ga nezakonitega kopiranja, medtem ko porota ni mogla sprejeti odločitve, ali je kriv nezakonite uporabe zaupnih znanstvenih podatkov. Čeprav ALeynikovu grozi zaporna kazen, mu najverjetneje tja ne bo treba, ker lahko sodišče upošteva, da je že prestal leto dni zapora.
