iGEM (International Genetically Engineered Machine competition) - slovenska skupina

Vsem hvala za cestitke!

Ampak glede na to, da je to znanost in tehnologija me zanima ali imate kaksno vprasanje glede te tehnologije.
Ali dvomite v kater del projekta?
Kje vidite probleme, s cim se ne strinjate.. itd...

->Kaj je split protein sistem?

Experimental procedure to detect protein-protein interactions that uses two fusion proteins (“hybrids”) which reconstitute an active transcription factor (or some other active protein) when the two fusion proteins interact.

Skratka, HIV se veze in posledicno preide na celico preko dveh membranskih receptorjev. Ta dva receptorja dimerizirata(prideta fizicno skupaj) zaradi vstopa HIVa v celico.
Split protein sistem pa je, da ko ta dva proteina dimerizirata s tem sprozita tudi dodaten signal. Ta signal je lahko transkripcijski faktor, ki potem prepisuje gene v jedru celice.

V nasem primeru je T7 polimeraza z dodatnim signalom za potovanje v jedru(geni so pa seveda v jedru).


->Kaj so efektorski geni? A so to geni za sintezo beljakovin?

Efektorski gen je v nasem primeru koncni mediator odziva na infekcijo s HIVom. To pomeni, da smo hoteli te gene 'sprozit' samo takrat ko je HIV prisel na celico oz v celico.
V nasem primeru gre za caspazo3 (sprozi apoptozo celice) ali interferon beta(antivirusni imunski odziv).


->Poleg tega pa, kako ste dosegli, da se ob sprožitvi teh efektorskih genov sproži ravno apoptoza (mislim, da je to samomor celice, če nimam prav, me popravite) in ne katera druga funkcija celice (recimo prepis viralne RNK v celično DNK)?

Sprozili smo ali samomor celice ali pa antiviralni imunski odziv.

Pri vsakem prepisu gena se naredi mRNA in kasneje se le ta prepise v protein.
Viralna DNA pa se ni imela casa prepisovati, ker smo jo prehiteli se preden se je integrirala v kromosom (ali pa ni imela dovolj casa za ucinkovito transkripcijo).
Nas sistem napade virus se preden je integriran v kromosom, trenutno zdravila pa mnogo kasneje.


->Katere spojine ste uporabili, kako jih dostaviti v celico in predvsem, kako ste dognail, katere spojine potrebujete?

Transfekcije smo delali z lipofectaminom(prenese rekombinantno DNA v celice) ali pa s komercialnim Genejuicom.

->ahemmm...po hodnikih na KIju se govori, da so rezultati bolj tako-tako, ker so študenti rajši počeli vse kaj drugega kot raziskovali.

Bullshit!!!!
Ce ma KI sam s sabo probleme, potem ne znajsajte tega na nas.

Rezultati so pa objavljeni!

ne znašam svojih frustracij, ampak samo sprašujem, ker ne vem.

hvala za pojasnilo.

Zase lahko rečem, da vam nisem prav nič "fouš", ampak vam uspeh iz srca privoščim.

kot biokemik tudi vem, koliko dela je potrebnega pri eksperimentalnem delu na takih sistemih.

jaz sem samo vprašal, kar sem od nekaj ljudi slišal. ni se potrebno takoj razpištoliti.

opravičujem se za razžalitev avtorjev tega projekta.

Razmišljate o kakem patentu? Se to da patentirat?