Slo-Tech Research Lab (BOINC)

Pred leti sem redno sodeloval pri drugih folding projektih, sedaj pa sem se odločil zadevo ponovno zagnati. Tokrat pod okriljem Slo-Tech-a.
Zaenkrat samo BOINC klient s projektom Rosetta, ki pokriva raziskave HIV/AIDS, raka, Alzheimerjeve ter malarijo ter še vrsto drugih raziskav povezanih s proteini. Predvsem bolezni, ki so daleč najbolj problematične saj zanje še vedno nimamo učinkovitih oz preizkušenih metod zdravljenja. Če bo interes dovolj velik lahko ustanovimo tudi druge skupine vendar bi se nekako držali medicinskih raziskav.

BOINC klient:
http://boinc.berkeley.edu

Rosetta@home:
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/

Slo-Tech Research Lab team ID:
11010

Slo-Tech Research Lab team (Rosetta):
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/team_...

Statistika:


Snemite BOINC klienta, se povežite na projekt Rosetta ter se pridružite ekipi 11010 (kako lep binarni zapis ekipne številke sem ujel) :)

Če vas karkoli zanima od tega kaj ti projekti počnejo pa do tega kako nastaviti klienta lahko vprašate tukaj, pa vam bom poizkusil pomagati.
Enako velja za lastnike Slo-Tech strani. Če imate kakšne predloge oz želje po spremembah prosim predlagajte tukaj pa bom prilagodil podatke.

Neke papirje je Dr. Baker objavil na http://www.pnas.org čeprav je podatkov res bolj malo. Baje je velik problem da "tradicionalni" bio raziskovalci ne priznavajo tega sistema (distributed computing) kot metodo za pridobianje rezultatov. Tko da pomoje je najbolj stvar v tem, da tukaj dobijo neke rezultate, potem jih morajo na podlagi izračunov poustvariti še na "stari" način in šele nato dobijo kakšne konkretne rezultate, ki jih hoče znanost priznati. Sem pa sem in tja ujel, da so dobili neke uporabne rezultate ampak zanje ni nobenih uradnih publikacij v kakšnih znanstvenih revijah (vsaj ne da bi vedel).

Če kdo najde kaj konkretnega prosim dajte link :)

EDIT:
http://www.nature.com/news/2010/100927/...

No, nekaj pa sem našel in zadeva je dost sveža. Vključuje pa ustvarjanje protiteles za virus HIV.

Drugače pa Baker vodi tudi dnevnik na tem linku:
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum...

Ne. Je nekaj projektov, ki uporabljajo NVIDIA GPU-je in en, ki uporablja ATI/AMD (Folding@home GPU). Rosetta teče izključno na CPU-ju. Torej če imate modernega quada ali pa 6 jedrnika je bolje :)

Da se vse nastavit, od tega koliko jeder hočeš uporbljat do tega koliko vsaega jedra, da se opravila pavzirajo če nek drug program porablja X % procesorja itd. Edino kar je, da spremembe pridejjo v veljavo šele ko snameš nov projekt, medtem ko pavziranje in druge stvari delujejo takoj.

EDIT:
Odpri BOINC klienta, preklopi v Advanced način, odklikaj v Advanced -> Preferences...
Tukaj lahko takoj nastaviš, koliko % procesorja hočeš obremeniti.

Za izbiranje koliko jeder hočeš koristit pa greš na ta naslov:
http://boinc.bakerlab.org/rosetta/prefs...

...in spremeniš vrednost "On multiprocessors, use at most" na toliko jeder kot jih hočeš koristit. Za te spremembe zna mal trajat da pridejo v veljavo. Intelova HT jedra se štejejo kot samostojna fizična, torej Core i7 920 lahko nastavite na 8 jeder, če pa imate npr Core i7 980X pa lahko nastavite tudi na 12. Uporabniki AMD Phenom X6 pa lahko nastavite na max 6.

To je tudi dober pokazatelj da imaš stabilno navit proc, če foldaš nekaj dni neprestano, kajne?

Zkaj zaboga ne morem urejat prvega posta v tej temi? Blesavo. Zdej ne morem ničesar novega dodat v tisto sporočilo :(

Zdej nej jim morim za vsako stvar, ki jo mislim dodat/spremenit. Forum je čist zgrešeno zastavljen in sam prosi, da spamaš miljavžent tem z isto tematiko namesto da bi lahko samo lepo urejal prvi post kot to podpirajo vsi drugi forumi...

Zakaj pa dve slo-tech ekipi?

Originalna zdaj pa še research lab?

dosy je 22. feb 2011 ob 04:26 izjavil:

Zakaj pa dve slo-tech ekipi?

Originalna zdaj pa še research lab?

Ekipa "Slo-Tech" ima večino creditov v projektih Einstein@Home in SETI@Home, "Slo-Tech Research Lab" pa v Rosetta@Home.

Rias Gremory je 16. okt 2011 ob 21:50 izjavil:

Obujam temo ker me zanima ali Rosetta@home podpira Windows 7 x64 oz. ali je odvisno samo od BOINCA podprtost?

http://boinc.berkeley.edu/wiki/Project_...
Platforms: Mac OS X, Linux/x86, Mac OS X (PowerPC), Windows, Windows/x64, Linux/x64