»

Sekvenciranje genomov virusov v Wuhanu ni odkrilo sorodnikov SARS-CoV-2

Slo-Tech - Priznana kitajska virologinja Shi Zhengli, ki v Inštitutu za virologijo v Wuhanu raziskuje viruse v netopirjih, je predstavila rezultate genetskega sekvenciranja celotnega genoma 56 novih betakoronavirusov in nekaj delnih sekvenc. Virusi, ki so bili zbrani v letih 2004-2021, ne izkazujejo večje sorodnosti s SARS-CoV-1 ali SARS-CoV-2. S tem Shi Zhengli zavrača nepotrjene teorije, da bi lahko povzročitelj covida pobegnil z Inštituta. Ta teorija je vzniknila kmalu po izbruhu pandemije, raziskovalci pa je niso nikoli potrdili, indici pa nakazovali, da je možnost majhna. Shi Zhengli je ves čas ponavljala, da v laboratoriju niso bili nikoli proučevali SARS-CoV-2. Zato je tudi sekvencirala vse zbrane viruse in razkrila rezultate.

Rezultati zadnje analize, ki jih je predstavila na nedavni konferenci na Japonskem, še niso objavljeni v recenzirani reviji. Strokovnjaki nad izsledki niso presenečeni, saj teoriji o pobeglem virusu nikoli niso pripisovali velike verjetnosti. Najbližje sorodnike...

30 komentarjev

SARS-CoV-2 na ljudi najverjetneje preskočil na wuhanski tržnici

Slo-Tech - Poltretje leto po preskoku SARS-CoV-2 na ljudi in sledeči pandemiji covida-19 so v Science objavili dve študiji, ki sta z različnimi metodami pokazali enako: virus se je na človeka najverjetneje prenesel na wuhanski tržnici z živalmi Huanan. Ta teorija bistveno bolje opiše zbrane podatke od alternativne hipoteze, da naj bi virus ušel iz laboratorijev inštituta za virologijo v Wuhanu. Rokopisa obeh raziskav ste bila že dlje časa dostopna na strežnikih z rokopisi, sedaj pa sta v Science objavljena kot recenzirana članka.

V prvem so analizirali pojavljanje prvih znanih primerov okužbe, tako v Wuhanu kakor neposredno na tržnici. Prve potrjene diagnoze so v lokalnih bolnišnicah zabeležili med 18. in 29. decembrom, še preden je bila tržnica Huanan izpostavljena kot zelo verjeten kraj prvega prenosa. Pregled podatkov o okužbah je pokazal, da je bilo 55 od 168 prvih primerov neposredno povezanih s tržnico. To se sicer sliši malo, a z današnjim znanjem o virusu ni nenavadno. Kakor danes je...

86 komentarjev

V Sloveniji verjetno odkrili novo različico SARS-CoV-2

Različice v Sloveniji do 23.3.2021

Slo-Tech - Minuli teden so pri sekvenciranju genomov iz vzorcev SARS-CoV-2, ki so odvzeti v Sloveniji potrjenim okuženim, odkrili kombinacijo mutacij, ki je doslej še niso poznali. Različica virusa B.1.258.17, ki je znana po mutacijah N439K, Δ69_70 in V772I (ima pa še druge), je dobila še mutacijo N501Y. Če bodo potrdili dovolj primerov te kombinacije mutacij (meja je pri 50), bo registrirana kot nova različica. A ne gre računati na to, da bo dobila ime slovenska različica. Poimenovanja po državah se sicer zdijo eno logična in enostavna, a jih tako za viruse kakor njihove različice Svetovna zdravstvena organizacija odsvetuje. Razlogov je več, ključna pa sta povezana s stigmatizacijo ("kitajskega virusa", kot so SARS-CoV-2 nekateri nasilno poimenovali, pač ne prenašajo Kitajci) in odkritjem. Četudi so varianto B.1.1.7, ki ji v medijih često pravijo britanski sev, res prvi odkrili v Veliki Britaniji, to ne pomeni, da je tam tudi nastala - podobno kot tudi španska gripa pred stoletjem nima vira...

328 komentarjev

Sledi za novim koronavirusom vodijo do netopirjev in luskavcev

Science Advances - Medtem ko so pretekle raziskave pokazale, da novi koronavirus SARS-CoV-2 izvira iz naravnih rezervoarjev, najverjetneje netopirjev ali luskavcev, znanstveniki še vedno raziskujejo, od kod točno se je vzel. Skupina ameriških raziskovalcev z univerz Duke, laboratorija Los Alamos, univerze v El Pasu in Univerze New York je podrobno raziskala genom virusa in ga primerjala z zbirko znanih genomov drugih virusov. Primerjali so več kot 6000 genomov SARS-CoV-2, izoliranega iz različnih bolnikov (tako veliko za analizo mutacij). Ugotavljajo, da virus večinoma izvira iz netopirjev, a je imel poljub sreče od luskavcev. Evolucija je iz kombinacije ustvarila SARS-CoV-2, ki povzroča covid-19. O tem pišejo v eni izmed vodilnih znanstvenih revij Science Advances.

Nekatere pretekle raziskave so kazale, da je virus najbolj podoben koronavirusom, ki jih najdemo v netopirjih, spet druge pa so kazale na večjo podobnost z luskavci. Sodi v skupino betakoronavirusov, kjer najdemo že kopico drugih...

90 komentarjev

NIH ukinil financiranje projekta o prenosu koronavirusov z netopirjev na ljudi

Wuhanski laboratorij. Slika: Hector Retamal/AFP

vir: Science Magazine
Science Magazine - Ameriški državni financer NIH (National Institutes of Health) je iz nepojasnjenih razlogov ukinil financiranje raziskave koronavirusov, ki se je ukvarjala z razumevanjem, od kod prihajajo in kako lahko z netopirjev preskočijo na ljudi. Nenadna prekinitev projekta, ki mu je bilo lani odobreno podaljšanje financiranja za 5 let, je sprožila polemike v raziskovalni skupnosti, da se na podlagi neresničnih govoric sprejemajo zelo resnične odločitve, piše Science. Projekt je bil ukinjen teden dni za tem, ko je ameriški predsednik javno ponovil (znanstveno ovrženo!) trditev, da je novi koronavirus ušel iz kitajskega laboratorija, in ob tem dodal, da bo ta omenjeni projekt končan zelo hitro.

Del ameriške politike še vedno ponavlja teorijo, da naj bi novi koronavirus, ki povzroča covid-19, nekako pobegnil iz laboratorija v Wuhanu. Raziskave tega ne podpirajo in kažejo, da ima novi virus izvor, kakor so ga imeli dosedanji, tj. preskok z živalske vrste na človeka. Tak dogodek je malo verjeten...

68 komentarjev

Od kod se je vzel novi koronavirus?

Slo-Tech - Čeprav mediji že od samega začetka poročajo, da se je novi koronavirus na ljudeh pojavil na tržnici v Vuhanu, kjer da je preskočil z živali, je internet poln drugačnih teorij, ki segajo od bioterorizma do ponesrečenega laboratorijskega poizkusa. Raziskovalci iz ZDA, Velike Britanije in Avstralije so z analizo genoma v Nature Medicine pokazali, da virus ni laboratorijska nesreča ali namerno gensko spremenjen. Kot že tolikokrat v zgodovini smo imeli smolo, da je napačen netopir ob napačnem času na napačnem mestu srečal napačnega človeka.

Strokovno ime za virus je SARS-CoV-2 in sodi v skupino koronavirusov, v kateri so ljudem nevarni še SARS-CoV, MERS-CoV ter štirje prehladi (HKU1, NL63, OC43 in 229E). Koronavirusov je sicer v naravi še več, saj okužijo predvsem živali. Obstajajo štirje rodovi koronavirusov: alfa, beta, gama in delta. Alfa in beta izvirajo iz netopirjev, gama iz ptičev, delta pa iz prašičev. Okužijo lahko tudi druge živali, denimo krave. SARS, MERS in SARS-2 (novi...

108 komentarjev